This directory contains a script that adds variants to a reference sequence in FASTA file format. There are multiple extant programs that can complete this task (e.g., bcftools consensus, GATK ...
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塩基配列中に改行が入ったFASTAファイルを2行単位のFASTAファイルに変換するシェルスクリプトです。Linux環境で動きます。 アセンブルしたデータやオンラインデータベースからダウンロードしたFASTAファイルは、配列中に改行が入っていることがしばしばです。
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