前回は、MD 法の概要と Python で環境を整えるところまでを書きました。 今回はいよいよ、Python から LAMMPS を実際に動かして、bcc Fe の初期構造を作るところまで進めていきます。 転位ループの挙動を見るためには、まず「きれいな結晶」を用意する必要が ...

LAMMPS_PYTHON_DIR = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)) LAMMPS_DIR = os.path.dirname(LAMMPS_PYTHON_DIR) LAMMPS_SOURCE_DIR = os.path.join(LAMMPS_DIR, 'src') ...

from lammps import lammps, LMP_STYLE_GLOBAL, LMP_STYLE_ATOM, LMP_TYPE_VECTOR, LMP_TYPE_ARRAY lmp.fix_external_set_energy_global("ext", 0.5) lmp.fix_external_set ...