JavaFXはRIAプラットフォームなだけあり、アニメーションに関する機能も充実している。ただし、アニメーションに関してはタイムライン、キーフレームなど、通常のGUIアプリケーションとは異なる概念を理解する必要がある(Flashユーザにはお馴染みの概念だ)。