Removes gap characters (-) from sequences in FASTA or plain text files. Translates DNA sequences from a FASTA file into protein sequences. Purpose: Converts coding DNA sequences into their ...

This project demonstrates foundational computational biology skills for parsing and handling biological sequence data in FASTA format using Python. The notebook focuses on reading sequence files, ...

この記事はすこし専門的な内容になっており、『生物学に特化した短編小説とエッセイ』とは別のマガジンに組み込まれています。 遺伝学とプログラミングに興味がある方はぜひ試してみてください。 ・fastaファイルに含まれる配列をアライメントして ...

NGS解析や遺伝子解析を行う際、FASTAファイルを染色体ごとに分割したい場面が多々あります。そこで、Pythonを使って簡単に染色体ごとにFASTAファイルを分割し、元のディレクトリに出力するスクリプトを作成しました。 このスクリプトは、染色体（または ...

When scientists are working with DNA or RNA sequences, a common way for these to be represented digitally is with FASTA files. FASTA files contain multiple sequences, each one identified by a header.

FASTA file processor is my latest software. Fasta files are a file format of representing DNA, RNA, and protein sequences. These files mainly contain two sections; the header the sequence. Because of ...